Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf85Q96MD7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf85Q96MD7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms