Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLHL15Q96M94 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL15Q96M94 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL15Q96M94 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms