Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC17Q96LX7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC17Q96LX7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms