Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALPK3Q96L96 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms