Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCORQ96JN0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms