Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RBM17Q96I25 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RBM17Q96I25 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBM17Q96I25 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM17Q96I25 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms