Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP2Q96HF1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms