Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNF8Q96H20 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNF8Q96H20 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNF8Q96H20 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms