Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARF2Q96GP6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF2Q96GP6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms