Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LTV1Q96GA3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LTV1Q96GA3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
LTV1Q96GA3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LTV1Q96GA3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
LTV1Q96GA3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
LTV1Q96GA3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LTV1Q96GA3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LTV1Q96GA3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LTV1Q96GA3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LTV1Q96GA3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LTV1Q96GA3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
LTV1Q96GA3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LTV1Q96GA3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LTV1Q96GA3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms