Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC74AQ96AQ1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC74AQ96AQ1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
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