Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VTI1AQ96AJ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VTI1AQ96AJ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms