Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1MTQ969P6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOP1MTQ969P6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1MTQ969P6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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