Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SMARCE1Q969G3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCE1Q969G3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCE1Q969G3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCE1Q969G3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms