Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP7Q93009 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP7Q93009 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP7Q93009 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP7Q93009 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP7Q93009 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP7Q93009 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP7Q93009 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
USP7Q93009 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP7Q93009 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP7Q93009 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP7Q93009 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP7Q93009 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP7Q93009 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP7Q93009 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP7Q93009 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP7Q93009 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP7Q93009 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP7Q93009 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP7Q93009 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP7Q93009 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP7Q93009 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP7Q93009 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP7Q93009 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP7Q93009 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP7Q93009 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP7Q93009 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP7Q93009 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP7Q93009 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP7Q93009 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP7Q93009 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP7Q93009 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP7Q93009 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP7Q93009 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP7Q93009 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP7Q93009 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP7Q93009 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP7Q93009 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP7Q93009 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP7Q93009 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP7Q93009 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP7Q93009 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP7Q93009 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP7Q93009 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP7Q93009 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP7Q93009 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP7Q93009 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP7Q93009 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP7Q93009 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP7Q93009 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP7Q93009 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP7Q93009 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP7Q93009 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP7Q93009 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP7Q93009 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP7Q93009 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP7Q93009 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP7Q93009 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP7Q93009 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP7Q93009 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP7Q93009 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP7Q93009 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP7Q93009 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP7Q93009 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP7Q93009 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP7Q93009 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP7Q93009 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP7Q93009 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP7Q93009 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP7Q93009 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP7Q93009 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP7Q93009 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP7Q93009 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP7Q93009 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP7Q93009 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP7Q93009 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP7Q93009 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP7Q93009 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP7Q93009 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP7Q93009 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP7Q93009 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP7Q93009 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP7Q93009 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP7Q93009 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP7Q93009 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP7Q93009 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP7Q93009 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP7Q93009 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP7Q93009 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP7Q93009 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP7Q93009 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP7Q93009 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP7Q93009 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP7Q93009 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP7Q93009 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP7Q93009 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP7Q93009 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP7Q93009 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP7Q93009 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP7Q93009 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms