Protein–RNA interactions for Protein: Q92925

SMARCD2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2Q92925 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCD2Q92925 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD2Q92925 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCD2Q92925 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCD2Q92925 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCD2Q92925 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCD2Q92925 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCD2Q92925 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms