Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC4Q92889 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC4Q92889 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC4Q92889 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms