Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD6Q92537 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD6Q92537 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms