Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PRUNE2Q8WUY3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRUNE2Q8WUY3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRUNE2Q8WUY3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms