Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HDAC7Q8WUI4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC7Q8WUI4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC7Q8WUI4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms