Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SSC4DQ8WTU2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSC4DQ8WTU2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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