Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBASH3BQ8TF42 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBASH3BQ8TF42 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3BQ8TF42 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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