Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD1Q8TEB9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDD1Q8TEB9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms