Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSDMBQ8TAX9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMBQ8TAX9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GSDMBQ8TAX9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMBQ8TAX9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms