Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms