Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HELBQ8NG08 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HELBQ8NG08 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HELBQ8NG08 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms