Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CNNM3Q8NE01 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CNNM3Q8NE01 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms