Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND76

CCNY, Cyclin-Y, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYQ8ND76 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNYQ8ND76 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNYQ8ND76 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNYQ8ND76 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms