Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNRF1Q8ND25 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNRF1Q8ND25 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms