Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms