Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM35BQ8NCS4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM35BQ8NCS4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM35BQ8NCS4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms