Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5C6

SRBD1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 995 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRBD1Q8N5C6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SRBD1Q8N5C6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRBD1Q8N5C6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRBD1Q8N5C6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms