Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHCHD4Q8N4Q1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHCHD4Q8N4Q1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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