Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4A0

GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT4Q8N4A0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GALNT4Q8N4A0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALNT4Q8N4A0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms