Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA13Q8N1Q1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CA13Q8N1Q1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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