Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC47Q8N1G4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC47Q8N1G4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC47Q8N1G4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LRRC47Q8N1G4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC47Q8N1G4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.6 ms