Protein–RNA interactions for Protein: Q8N159

NAGS, N-acetylglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGSQ8N159 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NAGSQ8N159 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NAGSQ8N159 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAGSQ8N159 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAGSQ8N159 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAGSQ8N159 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms