Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGI4Q8N135 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms