Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00518Q8N0U6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00518Q8N0U6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms