Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE1Q8N0S2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE1Q8N0S2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms