Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIMKLAQ8IXN7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms