Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC50Q8IVM0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms