Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFNL1Q8IU54 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
IFNL1Q8IU54 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms