Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GATAD2AQ86YP4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATAD2AQ86YP4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms