Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCA5Q86VQ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms