Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG4DQ86TL0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4DQ86TL0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG4DQ86TL0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms