Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF5Q86SE9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF5Q86SE9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms