Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP1BQ7LBR1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP1BQ7LBR1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP1BQ7LBR1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP1BQ7LBR1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP1BQ7LBR1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP1BQ7LBR1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHMP1BQ7LBR1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHMP1BQ7LBR1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms