Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LPCAT2Q7L5N7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LPCAT2Q7L5N7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LPCAT2Q7L5N7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT2Q7L5N7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms