Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.254e-8■■■■■ 27.3
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SND1Q7KZF4 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.81e-9■■■■■ 27.1
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SND1Q7KZF4 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 27.1
SND1Q7KZF4 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 27.1
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SND1Q7KZF4 ATP6AP2-216ENST00000636574 2027 ntTSL 516.6■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.115e-7■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.115e-7■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 ATP6AP2-208ENST00000635734 1851 ntTSL 514.84□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.325e-7■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 ATP6AP2-231ENST00000637955 1084 ntTSL 511.19□□□□□ -0.625e-7■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 ATP6AP2-204ENST00000447485 1254 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 P3H1-205ENST00000431412 836 ntTSL 59.79□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 TMX3-212ENST00000578765 480 ntTSL 45.63□□□□□ -1.513e-7■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.192e-9■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 STT3A-201ENST00000392708 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.672e-9■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.072e-9■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.014e-8■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.324e-8■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 GYPE-203ENST00000506264 1624 ntTSL 55.89□□□□□ -1.474e-8■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 APLP2-214ENST00000530132 542 ntTSL 421.54■■□□□ 1.049e-14■■■■■ 26.9
SND1Q7KZF4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.626e-7■■■■■ 26.9
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